Visualisasi dan Rekonstruksi 3D Citra Medis

            Paper atau jurnal kedua yang Saya baca berjudul “Visualisasi dan Rekonstruksi 3D Citra Medis : Review”. Paper tersebut ditulis oleh Candra Irawan, Erika Devi Udayanti, dan Fajar Agung Nugroho. Ketiga penulis tersebut dari Fakultas Ilmu Komputer, Universitas Dian Nuswantoro, Semarang. Pada bagian penutup, kesimpulan yang diberikan oleh penulis yaitu: Tantangan yang dihadapi dalam rekonstruksi citra medis 3D adalah operasi array yang menghabiskan banyak waktu. Selain itu juga mempertimbangkan kekurangan (limitation) dari hardware yang digunakan.

Setelah membaca paper ini, saya sedikit mendapat pencerahan tentang tema yang nantinya akan saya ambil. Sebelumnya saya masih sedikit bingung, nantinya aplikasi yang saya bikin ini seperti apa?, siapa yang menggunakan?, dan juga berbasis apa aplikasi yang akan dibuat?. Sepertinya tema yang akan saya angkat menjadi tugas akhir saya “pengolahan citra rontgen 3D”. Nantinya aplikasi ini akan berbasis desktop, dan penggunanya sejauh ini masih terpikir Dokter. Dalam paper ini penulis menggunakan Marching Cubes (MC) Algorithm, Marching Squares (MS) Algorithm, dan  Triangulated Irregular Network (TIN) Algorithm

Marching Cubes (MC) Algorithm  yaitu algoritma yang paling populer dalam rekonstruksi 3D, MC bekerja dengan merekonstruksi model 3D dari kumpulan citra 2D. Marching Squares (MS) Algorithm digunakan untuk menghasilkan contour guna memilih thresholds dalam rekonstruksi 3D. Contour terbentuk dari titik – titik dengan nilai yang sama yang saling terhubung membentuk garis. Triangulated Irregular Network (TIN) Algorithm. Awalnya algoritma TIN membuat lingkaran sekecil mungkin dengan perimeter melewati 3 titik (point) dan menarik kemungkinan segitiga (triangle) terbesar dari titik tersebut. Algoritma TIN secara luas telah dimanfaatkan pada banyak area aplikasi untuk membuat sambungan jaringan segitiga.

Berikut ini beberapa aplikasi yang digunakan dalam pengolahan visualisasi citra medis seperti Medical Image Processing Analysis and Visualization (MIPAV), Visualization Toolkit (VTK), dan Interactive Data Language (IDL). MIPAV adalah aplikasi pengolahan citra n-dimensi dan platform-independent untuk tujuan umum yang dapat mengolah citra medis dari berbagai jenis modalitas. MIPAV mendukung pembacaan data citra medis dengan berbagai format file, berbagai tipedata juga citra dengan n-dimensi. Tersedia pengguna antarmuka grafis untuk memanipulasi gambar seperti segmentasi dan pengukuran. Selain itu juga disisipkan tool analisis dan pengolahan citra dalam modul algoritma. Interactive Data Language (IDL) bahasa pemrograman visual berorientasi matrik (matrix-oriented) yang digunakan untuk analisa data dan memiliki library yang besar untuk displaying dan analisa gambar. IDL terdiri dari aritmatika PolyPaint untuk melakukan surface rendering, dan aritmatika ray cast untuk melakukan volume rendering. Visualization Toolkit (VTK) sebuah perangkat lunak system yang berorientasi objek untuk komputer grafis, pengolahan citra, dan visualisasi yang paling umum digunakan. VTK terdiri dari class library C++, dan beberapa interface layer seperti Tcl/Tk, Java, juga Phyton. Selain itu VTK telah terintegrasi dengan banyak algoritma yang memungkinkan user memadukan data dan algoritma citra 2D maupun 3D. Akan tetapi VTK hanya mampu berjalan pada windows platform.

                                  Proses Rekonstruksi 3D

Peningkatan Kualitas Citra Medik Pada Foto Rontgen Menggunakan Filter Frekuensi Tinggi

Saya diberi tugas oleh dosen saya (Pak Anung) untuk membaca dan memahi isi dari paper sesuai dengan konsentrasi dan topik apa yang akan saya ambil untuk tugas akhir. Saya mencari paper tersebut di scholar.google.com dan mendapatkan paper dengan judul “Peningkatan Kualitas Citra Medik Pada Foto Rontgen Menggunakan Filter Frekuensi Tinggi”. Pembuat paper tersebut adalah Catur Edi Widodo dan Kusworo Adi dari Laboratorium Instrumentasi dan Elektronika Jurusan Fisika Undip.

Pada paper ini penulis tidak menuliskan saran tetapi hanya menuliskan kesimpulan. Menurut penulis kesimpulan dari paper tersebut adalah : 1. Filter frekuensi tinggi menggunakan mask Sobel dapat memperjelas obyek dan mengaburkan latar belakang. 2. Obyek yang diproses dengan mask Sobel tersebut akan mengalami penipisan. Pada paper ini dijabarkan bahwa terdapat dua aspek dalam pencitraan diagnostik yaitu bagaimana memperoleh citra yang jelas sesuai dengan aslinya dan bagaimana memperoleh citra dengan karakteristik tertentu untuk mempertajam diagnosis.

Dasar teori atau landasan teori yang digunakan penulis yaitu citra dan pengolahan citra. Citra yang digunakan dalam bidang pengolahan citra berarti suatu fungsi kontinu dari intensitas cahaya. Pada citra digital terdapat titik – titik kecil segiempat, satuan terkecil dari suatu citra digital disebut picture element, pixel, pel. Citra berwarna dinyatakan menggunakan sinyal RGB (Red-Green-Blue). Pengolahan citra (image processing) untuk memperbaiki kualitas citra dengan suatu tujuan tertentu. Proses pengolahan citra terdapat lima proses yaitu: image restoration, image enchancement, image data compaction, image analysis, dan image reconstruction.

Metode yang digunakan penulis dalam paper ini antara lain. Objek penilitian berupa foto rontgen yang telah di scan dan sudah tersimpan di memori komputer kemudian dilakukan proses peningkatan citra menggunakan filter (mask Sobel) sebagai berikut :

-1         -2         -1                     -1         0          1

0          0          0          +          -2         0          2

1          2          1                      -1         0          1

Mask tersebut kemudian diterjemahkan menjadi algoritma yaitu:

Procedure SobelFilter (input mat:real, output result:real)

Var x,y:integer

            Result : real

For x := 0 to 319

            For y := 0 to 199

            Result := abs(-mat[0,0]-2*mat[0,1]-mat[0,2]+mat[2,0]+2*mat[2,1]+mat[2,2])

                          +abs(-mat[0,0]+mat[0,2]-2*mat[1,0]+2*mat[1,2]-mat[2,0]+mat[2,2])

            next y

next i

Hasil dari pemrograman yang dilakukan dengan input berupa rontgen citra vena yaitu citra hasil dapat dilihat bahwa daerah berfrekuensi adalah bagian latar belakang rendah telah mengalami penurunan intensitas. Daerah frekuensi tinggi yaitu gambar obyek vena mengalami peningkatan intensitas sehingga terlihat jelas. 

                                                            Citra Rontgen sebelum diolah

                                                  menjalankan fungsi Sobel di matlab

Gambar (a) citra rontgen sebelum diolah, gambar (b) citra setelah diolah dengan Sobel

Rabu, 23 Juni 2013

   PT. PINDAD

    PT. PINDAD adalah industri manufaktur milik pemerintah Indonesia yang mengkhususkan diri dalam produk militer dan komersial. Kegiatannya meliputi desain, pengembangan, rekayasa dan fabrikasi serta pemeliharaan.Didirikan pada tahun 1808 sebagai bengkel peralatan militer di Surabaya dengan nama Artillerie Constructie Winkel (ACW), bengkel ini berkembang menjadi sebuah pabrik dan sesudah itu telah mengalami perubahan nama yang sama, ia pindah ke Bandung pada tahun 1923. Belanda menyerahkan pabrik ke Pemerintah Indonesia pada April 29, 1950  Kemudian pabrik resmi bernama Pabrik Senjata Dan Munisi (PSM) (Inggris: senjata dan amunisi pabrik). Dan berlokasi di mana PT. PINDAD terletak sekarang. Sejak saat itu PT. PINDAD telah berubah menjadi sebuah industri alat dan peralatan militer di bawah pengelolaan TNI (Tentara Nasional Indonesia). PT. PINDAD berubah 29 April 1983. Badan berubah menjadi PT. Pakarya Industri (Persero) dan kemudian berubah lagi menjadi PT. Bahana Pakarya Industri Strategis (Persero).Pada tahun 2002, status PT. PINDAD (Persero) kembali diubah oleh pemerintah, dan sejak itu perusahaan berada di bawah Kementerian Negara BUMN. Selama bertahun-tahun, Pindad telah menerima pengunjung dari delegasi yang dikirim oleh Bangladesh, Brunei dan Jerman penghargaan. Pindad telah menerima penghargaan, baru-baru ini yang diberikan kepada presiden Budi Santoso oleh Susilo Bambang Yudhoyono karena penciptaan Pindad SS1 SS2 Pindad & senapan yang memungkinkan Angkatan Darat Indonesia untuk menang di akhir Asean Army Rifle Temui kontes XVI tahun 2006.

Rabu, 26 Juni 2013

PT BIZNET

    PT. Biznet  adalah operator telekomunikasi fixed-line dan operator multimedia di Indonesia yang memberikan layanan jaringan (network), layanan internet, pusat data, serta layanan hosting dan cloud computing. Biznet Networks didirikan pada tahun 2000 dengan fokus pasar pada dunia korporat. Biznet memiliki dan mengoperasikan jaringan serat optik mutakhir dengan pusat data terbesar di Indonesia, dan juga telah menyediakan layanan premium dengan performa jaringan yang cepat dan handal. Pada tahun 2006, Biznet Engineering Labs telah menciptakan Biznet Metro, Carrier Grade Metro Ethernet Network pertama di Indonesia. Pada tahun 2007, Biznet Engineering Labs meluncurkan Biznet Metro FTTH, jaringan serat optik yang melayani sampai ke wilayah perumahan, pertama di Asia Tenggara. Biznet Networks sudah terkoneksi secara langsung ke beberapa Tier-1 backbone dan Internet Exchange terkemuka di dunia untuk memberikan kecepatan dan rute yang singkat ke jaringan yang ditujukan. Biznet juga sudah melakukan perjanjian direct peering dengan beberapa leading content provider lainnya di dunia. Biznet memiliki dan memelihara ribuan kilometer saluran serat optik dan kabel di sekitar Jakarta, Bali, Bandung dan daerah Surabaya. Biznet juga memiliki dan mengoperasikan jaringan Biznet InterCity yang menghubungkan kota-kota besar di Pulau Jawa. Biznet menggunakan beberapa teknologi jaringan seperti Metro Ethernet, GE-PON (Gigabit Ethernet Passive Optical Network), HFC (Hybrid Fiber Coaxial), NG-SDH (Next Generation - Synchronous Digital Hierarchy) dan MPLS (Multi Protocol Switching Layer).Cakupan jaringan Biznet mengoperasikan POPs internasional yang terletak di Manila - Filipina, Hong Kong, London - Inggris, Palo Alto - Amerika Serikat, Seoul – South Korea, Singapura, Sydney - Australia, Tokyo - Jepang dan terhubung ke Internet Exchange utama di dunia.

29, Mei 2013

 PEMBUATAN BLOG

1. Untuk memulai mendaftar blog di blogspot silahkan kunjungi alamat situs  www.blogger.com, setelah itu cari tombol Sign up (daftar) yang ada di pojok kanan atas, seperti gambar di bawah ini

2. Setelah tombol sign up diklik, nanti akan muncul aplikasi pendaftaran pembuatan akun gooogle, seperti gambar di bawah ini. Silahkan lengkapi aplikasi tersebut. Gambar di bawah ini merupakan contoh pengisiannya.

Penjelasan pengisian : pada bagian Name, Isi nama  depan dan nama belakang kamu.

Pada Choose your username,  isi sesuai dengan keinginanmu, username ini nantinya berfungsi sebagai email login untuk akses ke dashboard blogspot kamu dan bisa juga untuk login ke Gmail. (jika username tidak tersedia, tambahka angka atau huruf di belakangnya),

Pada Create a Password, isi password kamu (gunakan yang mudah diingat), pada Confirm your password silahkan isi dengan password yang sama dengan password pada kolom pada create a possword tadi.

Pada birth day isi tanggal lahir kamu.  Pada Phone, isi dengan nomor ponsel kamu, untuk Curent your email, dikosongkan saja.  Pada type the two pieces of text, ketikan dua buah teks kode yang ada di atasnya.  Selanjutnya beri tanda centang pada dua kotak kecil di bawahnya, dan yang terakhir Klik pada tombol Next step.

3. Setelah kamu klik pada tombol next, akan ditampilkan perintah verifikasi akun, silahkan masukan nomor ponsel kamu. Kemudian klik tombool Send Verifikation Code. Nanti kamu akan mendapat sms dari google yang berisi  kode aktifasi.

4.  SMS kode verifikasi dari google ke ponsel kamu akan tampak seperti gambar di bawah ini.

5.  Masukkan kode verikasi sms di atas pada kolom yang tampil, seperti gambar di bawah ini. kemudian klik tombol Verify

6.  Jika langkah sebelumnya berhasil, kamu akan menjumpai halaman seperti gambar di bawah ini. Untuk menambahkan foto silahkan klik add profile photo,  jika ingin langsung ke langkah selanjutnya silahkan klik tombol Next Step.

7.   Selanjutnya akan tampil halaman seperti gambar di bawah ini. Ini merupakan tanda bahwa kamu telah memiliki sebuah akun google  berupa alamat email yang bisa digunakan untuk login ke Gmail.com dan blogger.com, selanjutnya silahkan klik tombol Back to blogger.

8. Jika melihat halaman seperti gambar di bawah ini abaikan saja , biar lebih cepat dalam membuat blog. SIlahkan klik tombol lanjutkan ke blogger.

9.   Setelah itu kamu akan masuk ke halaman utama Dashboard blogger. Di dashboard ini kamu bisa membuat blog, menulis posting, mengatur tema dan lain-lain.  Untuk membuat blog pertama kali klik tombol Blog Baru.

10.  Setelah tombol blog baru diklik, akan muncul  jendela pembuatan blog.  Pada bagian Judul isi  Judul blog kamu, pada bagian Alamat isi dengana alamat blog yang kamu inginkan. Pada template, pilih salah satu template yang kamu inginkan.  Kemudian klik tombol buat blog

11. Setelah langkah-langkah di atas, blog kamu sudah berhasil di buat.  Untuk menulis posting silahkan klik tombol Pensil, sedangkan untuk melihat tampilan blog yang masuk kosong (belum ada artikelnya) silahkan klik tombol lihat blog.

Rabu , 22 Mei 2013

PENTINGNYA LAPORAN KEGIATAN

Pengertian Laporan Kegiatan

Laporan kegiatan adalah suatu ikhtisar tentang hal ikhwal pelaksana suatu kegiatan, yang harus disampaikan oleh pembina kepada pihak yang memberi tugas sebagai pertanggungjawaban.

Pentingnya Laporan Kegiatan

Laporan kegiatan merupakan alat yang penting untuk :

a.         Dasar penentuan kebijakan dan pengarahan pimpinan.

b.         Bahan penyusunan rencana kegiatan berikutnya.

c.         Mengetahui perkembangan dan proses peningkatan kegiatan.

d.         Data sejarah perkembangan satuan yang bersangkutan dan lain-lain.

Macam Laporan Kegiatan

a.         Ditinjau dari cara penyampaian, terdapat :

1)       Laporan lisan, disampaikan secara lesan, biasanya dilakukan hal-hal yang perlu segera disampaikan laporan lisan dapat dengan tatap muka, lewat telepon , wawancara dan sebagainya.

2)       Laporan tertulis, disampaikan secara lengkap dalam bentuk tulisan.

b.         Ditinjau dari bahasa yang digunakan, terdapat :

1)       Laporan yang ditulis secara populer, yang menggunakan kata-kata sederhana, kadang-kadang diselingi dengan kalimat humor / lucu.

2)       Laporan yang ditulis secara ilmiah, sebagai hasil peneliti. Biasanya isinya singkat tetapi padat dan sistimatis serta logis.

c.         Ditinjau dari isinya, dapat dibedakan :

1)       Laporan kegiatan, misalnya pelaksanaan perkemahan, pelaksanaan ujian SKU, SKK, Pramuka Garuda.

2)       Laporan perjalanan, misalnya laporan wisata, pengembaraan, penjelejahan dan sebagainya.

3)       Laporan keuangan, menyangkut masalah penerimaan dan penggunaan uang.

Sistimatika Laporan

Hendaknya laporan lengkap, dapat menjawab semua pertanyaan mengenai : apa ( what ), mengapa ( why ), siapa ( Who ), dimana ( where ), kapan ( when ), bagaimana ( how ).

Urutan isi laporan sebaiknya diatur, sehingga penerima laporan dapat mudah memahami. Urutan isi laporan antara lain sebagai berikut :

1.       Pendahuluan

Pada pendahuluan disebutkan tentang :

a.       Latar belakang kegiatan.

b.       Dasar hukum kegiatan.

c.       Apa maksud dan tujuan kegiatan.

d.       Ruang lingkup isi laporan.

2.       Isi Laporan

Pada bagian ini dimuat segala sesuatu yang ingin dilaporkan antara lain :

a.       Jenis kegiatan.

b.       Tempat dan waktu kegiatan.

c.       Petugas kegiatan.

d.       Persiapan dan rencana kegiatan.

e.       Peserta kegiatan.

f.         Pelaksanaan kegiatan (menurut bidangnya, urutan waktu pelaksanaan, urutan fakta / datanya).

g.       Kesulitan dan hambatan.

h.       Hasil kegiatan.

i.         Kesimpulan dan saran penyempurnaan kegiatan yang akan datang.

3.       Penutup

Pada kegiatan ini ditulis ucapan terima kasih kepada yang telah membantu penyelenggaraan kegiatan itu, dan permintaan maaf bila ada kekurangan-kekurangan. Juga dengan maksud apa laporan itu dibuat.

Hal-hal yang perlu diperhatikan

Laporan diusahakan agar :

a.          Singkat dan padat.

b.          Runtut atau sistimatis.

c.          Mudah dipahami isinya.

d.          Isinya lengkap.

e.          Menarik penyajiannya.

f.            Berpegangan pada fakta, data dan persoalannya.

g.          Tepat pada waktunya.

Lain – lain.

a. Dalam laporan dapat dilampirkan : photo-photo kegiatan, tanda bukti, surat-surat keterangan dan sebagainya ( copy )

b. Untuk mempermudah penyusunan laporan sebaiknya tetap mengacu pada proposal yang pernah diajukan.

c. Memberikan Laporan kegiatan dengan tembusan kepada satuan/ lembaga yang terkait. ( Mabi, Kwartir, Sponsor dll )

ANGGARAN KKL (UPDATE)

Survei                            Rp    500.000

Sie. Acara                      Rp 1.000.000
    - Spanduk
    - Plakat
    - Acara

Sie. Dokumentasi           Rp    200.000

Sekretariatan                  Rp    250.000

Seminar                          Rp 2.000.000

P3K                                 Rp    200.000

Transportasi                    Rp 1.000.000

Kaos KKL                        Rp 2.600.000
    @ Rp 50.000 x 52
 
Konsumsi                        Rp 3.000.000

Penginapan                     Rp 3.000.000 +

TOTAL                             Rp 13.750.000



PEMASUKAN:
- Fakultas                         Rp 6.500.000 -
                                         Rp 7.250.000

Rp 7.250.000 / 52 peserta = Rp 150.000